ForBio course: Phylogeographic methods

Time and place:
Sep 16, 2013 12:00 PM – Sep 24, 2013 05:00 PM, University of Tromsø, Tromsø, Norway

Extended deadline: first come, first serve!

Teachers: Dorothee Ehrich (University of Tromsø) and Andreas Tribsch (University of Salzburg)

Phylogeography combines phylogeny with biogeography and investigates the geographic distribution of intra- or interspecific genetic variation. In this course we will introduce the theoretical basis of phylogeography, genetic markers used, and data analysis. The main part will be a computer course in analyzing and interpreting phylogeographic data. We will start with basic analyses and introduce more advanced methods. The course is also meant to be a workshop, where it will be possible to discuss concepts, ideas and analyses, so participants are encouraged to bring their own data to analyse. Participants will also receive a number of scientific articles on the topic to study before the course.

Contact Sergei Drovetski (sdrovetski@gmail.com) for registration. Find more information at www.forbio.uio.no/events/courses/2013/phylogeography.html

Welcome!

 

 

Postdoc: worm genomics in Stockholm

Post-doctoral researcher

 

A postdoc position is available in the research group of Ulf Jondelius at the Swedish Museum of Natural History, Stockholm.
We are looking for a highly motivated postdoc with interest in animal evolution for a project using data from genome sequencing of microscopic marine worms (Acoelomorpha). Acoelomorpha are simple animals lacking many features present in other Bilateria (e.g. circulatory system, body cavity, excretory organs). Their phylogenetic position is highly contested: they have been proposed to be either the earliest extant bilaterians, part of the flatworms, or deuterostomes closely related to echinoderms and hemichordates. The conflicting hypotheses imply widely disparate interpretations of their morphological evolution as either primitively simple or secondarily reduced in complexity. We will sample genomic data to cover acoelomorph diversity aiming to reconstruct their phylogenetic position within the Metazoa and study the structure of the genomes expecting to find either a simple basal metazoan genome or higher bilaterian and deuterostome signatures. The succesful candidate will work on assembly and analysis of genomes from several acoelomorph species together with the PI, collaborators, students, and technicians and will be responsible for analyzing results, writing manuscripts, and contributing to the development of the project.

 

The project is a collaboration with SciLife lab in Stockholm and Uppsala and colleagues at the Sars Centre in Bergen, Norway.

Qualifications

The ideal candidate has a recent PhD in Bioinformatics, Genomics, Molecular or Evolutionary biology or related fields, experience in analyzing next-generation DNA sequence data, and a record of publishing in scientific journals.  Programming experience in a scripting language (such as Python or Perl) is desirable.

 

Starting date is September 1, 2013. The appointment is for two years.

 

Informal inquiries should be directed at  Ulf Jondelius (ulf.jondelius@nrm.se). The union representatives are Bodil Kajrup, SACO-S and Yvonne Arremo, ST can be reached at telephone number + 46 8 519 540 00.

 

How to apply:  Applicants should submit (1) a cover letter describing your
research interests and background, (2) a detailed CV (including
publications), and (3) the contact details of three references as a single pdf document to rekrytering@nrm.se or to Swedish Museum of Natural History, Box 50007, SE 104 05 Stockholm, Sweden, no later than May 10, 2013. Mark your application with dnr 2.3.1-144-2013

ForBio field courses on Greenland

The Research school in biosystematics – ForBio invites members and associates to participate in field courses on Greenland 2013.

We offer a terrestrial course covering vascular plants and arthropods July 15 – August 1, and a marine course September 9 – 27.

More information can be found at http://www.forbio.uio.no

Questions regarding the terrestrial course can be directed to Heidi Solstad (heidi.solstad@ntnu.no) and Christiane Todt (Christiane.Todt@um.uib.no) can answer questions about the marine course.

Registration deadline is January 31.

Stina Weststrand vinnare i Forskar Grand Prix

Stina Weststrand (Systematisk biologi, Uppsala Universitet) vann i fredags tävlingen Forskar Grand Prix i Uppsala då hon under tre minuter beskrev sin forskning om mosslumrar. Grattis Stina!

Mer information om tävlingen hittar ni på Uppsala universitets hemsida: http://www.uu.se/nyheter/nyhet-visning/?id=1984&area=1%2C2%2C5%2C13%2C16&typ=artikel&na&lang=sv

Doktorand-dag 8/5, med fokus på karriärplanering för doktorander i Systematik

Career-planning for young systematists! 8/5 will be a pep-talk day for PhD students and recently defended PhDs in Systematics, with the aspiration to give some insight in the Swedish funding systems and strategies for a life after PhD, for those of you who wish to continue with research in systematics in Sweden! If non-Swedish-speakers want to attend, it will be given in English! The arrangement is a collaboration between the Swedish Systematics Association, the Swedish Taxonomy Initiative, and the Swedish Museum of Natural History.

8 maj anordnar Svenska Systematikföreningen, i samarbete med Svenska artprojektets forskarskola och Naturhistoriska riksmuseet, en doktoranddag med fokus på karriärplanering inom forskning för doktorander och nydisputerade inom ämnesområdet systematik. Vi kommer att ta upp och diskutera möjligheterna att hitta försörjning inom forskningsbranchen, forskningsfinansiärer och beredningsprocessen, meriter och meritvärdering, postdoc och ansökningsskrivande. Alla doktorander inom systematikområdet och angränsande fält är varmt välkomna, liksom nydisputerade systematiker!

Plats: Naturhistoriska riksmuseet, konferensrum 525

Föreläsare: Mats Wedin (mats.wedin@nrm.se) + några inbjudna som delar med sig av sina postdoc-erfarenhete

Anmälan: Rikard Sundin (Rikard.Sundin@slu.se). Sista anmälningsdag 2 maj.

Preliminärt program

09.00-09.30     Ankomst med fika

09.30-11.30     Postdoc. Sverige och livet efter detta för den nydisputerade systematikern. Hur fungerar det med externa forskningsbidrag, och vilka är möjligheterna att hitta en försörjning efter disputationen inom forskningsbranchen? Vilka är forskningsfinansiärerna och hur går ansöknings- och beredningsprocessen till? Vad bedöms och hur värderas meriter? CV, publicering, meriter för olika ändamål. Jämförelser av några CVn. Planera för postdoc.

11.30-12.30     LUNCHPAUS

12.30-14.30     Postdoc. Två framgångsrika kollegor som ganska nyligen kommit tillbaka till landet från sina respektive postdoc-vistelser berättar om sina erfarenheter.

Att fundera på: Breddning vs specialisering. Finansiering. Förväntat resultat – att bli ”sin egen”. Hur skall man optimera postdoc-tiden? Vad behöver man tänka på när man åker utomlands och när man kommer tillbaka till Sverige? Hur lyfter man fram sin postdoc i en ansökan?

14.30-14.45     Kafferast

14.45-16.00     Post-postdoc! Söka egna projekt-medel och jobb. Att skriva ansökan. Att tolka utlåtanden (eller inte). Hur ser en framgångsrik ansökan och ett framgångsrikt CV ut? Vem får pengar och varför? Att inte låta sig nedslås…

Svenska artprojektet lyser ut medel/Swedish Taxonomy Initiative announces grants

This message will follow in English

Svenska artprojektet har i dagarna lyst ut medel för taxonomisk forskning och inventering. Projekten ska behandla taxonomin hos grupper av flercelliga organismer som är dåligt kända, d.v.s. i behov av taxonomisk revision i Sverige/Norden. Mindre inventeringar kan ingå i ett vanligt forskningsprojekt, men medel för inventeringar av mycket dåligt kända grupper kan också sökas som eget projekt. För att komma ifråga för stöd krävs att sådana inventeringar förväntas resultera i ett flertal nya arter för landet. Sista ansökningsdag är 1 juni 2012.

Tipsa gärna andra som du tror kan vara intresserade av denna utlysning!

Läs mer på vår hemsida: http://www.slu.se/sv/centrumbildningar-och-projekt/artdatabanken/svenska-artprojektet1/forskning/anslag-att-soka/

The STI has announced grants for taxonomic research and inventories. The projects should study the taxonomy of poorly known groups of multicellular organisms, i. e. groups that are in need of taxonomic revision in Sweden/the Nordic countries. Smaller inventories can be included in a research project, but it is also possible to apply separately for inventories of poorly known groups. Such inventories should be expected to result in a large number of new species for Sweden. Last day of application is 1 June 2012.

Read more on our webpage: http://www.slu.se/en/centrumbildningar-och-projekt/artdatabanken/svenska-artprojektet1/forskning/anslag-att-soka/

Foto- och bildtävling: Gröna Linsen 2012

Våren börjar så sakteliga krypa fram och Svenska systematikföreningen SSF vill härmed kungöra årets stora foto- och bildtävling: Gröna Linsen 2012!

Tävlingen startar nu och för att kunna delta (både bidra och rösta) behöver du vara medlem och ha ett användarkonto. Du som inte redan registrerat dig på hemsidan kan göra det här (även om du inte tänker delta i tävlingen):

http://systematikforeningen.se/wp-login.php?action=register

Dina tävlingsbidrag bör antingen visa upp svensk biodiversitet i form av organismer eller habitat eller illustrera forskningsaktiviteter eller pedagogiska situationer. Bidrag kan vara antingen foton eller teckningar/målningar och tävla inom dessa kategorier:

  • Växtbilder
  • Djurbilder
  • Svampbilder
  • Mikroskopbilder
  • Pedagogiska bilder
  • Forskningsbilder

Du laddar själv direkt upp dina tävlingsbidrag till hemsidan. Sista dagen för att skicka in bidrag är den 1:a juli (veckan efter midsommar). Den bild som rankas högst av alla vinner tävlingens förstapris: en välgjord förstoring av det vinnande bidraget som kommer att delas ut på Systematikdagarna i Uppsala i November. Mindre men fina priser delas även ut till vinnarna inom vardera kategori. Teknisk information om hur du förbereder bilderna och laddar upp dem hittar du på hemsidan:

FAQ

http://systematikforeningen.se/wiki/faq-om-hemsidan/

Direkt länk

http://systematikforeningen.se/wiki/faq-om-hemsidan/#hur-fungerar-foto-bildtavlingen-grona-linsen-2012-hur-gor-jag-for-att-delta-hur-rostar-jag

Skulle det uppstå tekniska problem eller om du har frågor angående tävlingen så kan du höra av dig i denna forumtråd:

http://systematikforeningen.se/forums/topic/bildtavlingen-2012/

Lycka till!

Hugo de Boer försvarar sin avhandling

Fredagen den 30:e mars kl 13:00 försvarar Hugo de Boer sin etnobotaniska och växtsystematiska avhandling med titeln ” Snake Gourds, Parasites and Mother Roasting: Medicinal plants, plant repellents, and Trichosanthes (Cucurbitaceae) in Lao PDR” i Lindahlsalen på Evolutionsbiologiskt centrum (EBC), Norbyvägen 18, vid Uppsala universitet. Opponent är Prof. Victoria Reyes-Garcia, Universitat Autonoma de Barcelona. Om allt går vägen blir det knytkalas i Zootissalen på EBC till kvällen.

Här finner du mer information om Hugos forskning och avhandling.

Lycka till Hugo!

Bukhårsdjur i pressen

Tidningen Smålänningen har i dagens nummer ett fint reportage med Tobias Kånneby (disputerad vid Naturhistoriska riksmuseet i fjol) där han beskriver sin forskning om evolution och mångfald hos bukhårsdjur (Gastrotricha) i synnerhet samt systematikens betydelse för att förstå evolution i allmänhet.

Tyvärr finns inte reportaget på nätet så ni som inte prenumererar på Smålänningen får nöja er med den korta texten på tidningens framsida.

Grattis Tobias!